L'introduction de cultures pluriannuelles conduit globalement à une réduction de l'usage de produits phytosanitaires et d'engrais minéraux à l'échelle de la rotation, donc à une réduction des risques de transfert. Attention cependant à la destruction : le retournement d'une culture pluriannuelle s'accompagne d'une reprise de minéralisation intense qui peut entraîner des risques de perte d'azote par lixiviation d'autant plus importants que la culture était en place depuis longtemps.

L'introduction de cultures pluriannuelles conduit à une réduction du nombre d'interventions de travail du sol à l'échelle de la rotation, donc à une réduction de la consommation de carburant. De plus, elle conduit aussi à une réduction d'usage d'engrais minéraux, donc à une réduction de la quantité d'énergie consommée pour leur fabrication.

L'introduction de cultures pluriannuelles conduit à une réduction des dégagement de GES liés aux interventions de travail du sol ou à la fabrication d'engrais minéraux. Par ailleurs, la réduction d'usage d'engrais azotés minéraux s'accompagne d'une réduction des émissions de protoxyde d'azote par dénitrification. D'autre part, les prairies fixent du carbone dans leur propre biomasse et dans la matière organique produite (racines mortes, résidus, qui se transforment en humus